荒海地区的机关立方与雷柱解谜是稻妻地图中较为复杂的谜题之一，主要涉及雷元素方碑、雷立方机关以及水位控制机制。首先需要找到荒海中央大树旁的四根雷柱，其中一根雷柱需要完成雷元素解谜，让所有图标朝向同一方向即可解锁，其余三根雷柱可直接用雷元素攻击点亮。点亮全部雷柱后返回井边启动机关圆盘，井口会打开，玩家可进入地下区域继续探索。需部分雷柱位置较为隐蔽，例如第三根雷柱位于较远的山坡前，第四根雷柱则需要通过樱花石块机关解密触发。

进入地下区域后，玩家会面临两组雷立方机关解谜。第一组位于深井旁，初始状态下只需攻击右上角方块两次即可完成解密。第二组位于井底左手边，包含五个雷立方，解密方法较为复杂：首先调整1号和4号方块方向使其一致，随后通过调整2号方块同步1号与4号方向，使其与3号方块同向，接着调整3号方块使1、3、4号方块与中间方块同向。若解密过程中顺序被打乱，可退出游戏重新加载恢复初始状态。完成解密后水位会下降，玩家可继续深入探索。

荒海地下还涉及神樱大祓任务的相关解谜，需要按照特定顺序激活雷元素方碑。具体顺序为前1、左3、左上2、右3、右上2。完成该任务后会出现新的探索区域，需注意右手边大门需要解锁两个仙灵才能开启，其中一个仙灵位于柱子上，另一个在大祓树左侧。部分区域需要使用留念镜照射小狐狸雕像才能触发隐藏机关，例如柱子下方和神樱树周围的雕像。

最终阶段的解谜包含恒常机关挑战和秘境入口机关。恒常机关附近有精英怪守护的宝箱，建议使用高爆发队伍应对。秘境入口处设有走格子机关，需从起点出发不重复地走完所有方块到达蓝色终点。若解密失败，可通过离开区域重新加载重置机关状态。完成全部解谜后可获得包含华丽宝箱在内的多项奖励，部分宝箱位于圆柱墙顶端或隐藏水潭底部，需仔细探索避免遗漏。